Existem muitas diferenças nas regulamentações fitossanitárias de países como a Nova Zelândia e Austrália, com regulamentações fitossanitárias muito rigorosas, em comparação com o sistema fitossanitário comum estabelecido na Europa, que mantém uma autorização geral para as importações como um todo.

As características particulares das regiões insulares participantes no projecto expõem-nas, neste quadro comum, aos riscos de entrada de organismos nocivos que não ocorrem no continente.

O projecto CUARENTAGRI visa implementar o sistema fitossanitário das regiões ultraperiféricas europeias participantes e contribuir para a melhoria de outras regiões participantes.